还想补充一个问题,因为我的物种是杨树,已经多个基因组公布,我能不能根据他们来进行同源预测,需要的gff文件是什么样的,因为我在phytozome下载的gff3文件打开跟database中的gff内容不一样,还有就是我计划用毛果杨4.1版本做17.liftoff.sh,想问下应该用下图中哪个gff3文件?还有就是18.PASA.sh中est应该用下图中哪个文件...
回答于 2024-12-17 23:42
上图是生成的文件,似乎是缺少什么索引或者排序导致的,我的HIC是用的AAGCTT,核实过
回答于 2024-12-17 23:15
解决了,要把之前生成的sort.bam文件删除
回答于 2023-12-01 16:11