关于如何确定segmental duplication events

attachments-2019-03-xaRyCgVB5c89b4cf58f22.jpg如图,我用虚拟机做出circos图,过程中需要比对出具有同源性的基因对然后再图中以连线的形式表达出来,那么请问老师在这些基因对中如何确定是不是segmental duplication events呢,是不是说在比对基因组过程中所有比对出来的同源基因都是属于segmental duplication events?请老师辛苦做出详细解答,对于这一概念确实有些不太懂。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

关于基因家族基因串联重复基因和片段复制概念可以参考:https://www.omicsclass.com/question/1

你贴图中如果是用mcscanX分析出的几个,我推测蓝色的连线都是segmental duplication events

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