MEGA构建系统发育树时总是报错 No common sites found

已经筛选好了保守结构域，但是构建系统发育树时总是报错

老师您好，我想问下我通过hummer得到的蛋白序列用mega构建进化树，出现报错No common sites found，报错之后让我进行Pairwise Distances计算，随后删除带有n/c的序列，随后才能构建进化树，请问下这种情况为什么会出现，应该怎么解决

差异太大，可以删除gap试试； https://www.omicsclass.com/article/221

omicsgene - 生物信息

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS | 采纳率 8% | 回答于 2018-07-26 22:36

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其它 1 个回答

smyang2018 - 学生 2018-07-26 22:33

感觉像是有序列和其他的在进化上的距离太远了，或者说比对匹配度低了