老师,您好,请问kaks_calculator只能一次性计算一对基因吗 能不能一次性计算多个基因对呀

3 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

目前没有,会perl的话,可以用perl写一个小流程,批量进行计算;

老师,我手里有20对复制基因对需要计算kaks,有没有什么办法能够一次性计算全部的,然后从结果里面提取这20对的kaks值呢

没有好的方法,不会perl的话只能手动。

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安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

kaks_calculator可以一次计算多对基因,其输入文件为axt格式,如下图所示。但是输入文件准备时需要一对一对的获取。

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雪儿

你好,这个问题你解决了吗?

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