老师,在做基因的顺势作用原件的过程中,最后形成两个配置文件,视频里说,通过对下面文件划线处命令的编写可以筛选想要的顺势作用原件。但是老师,我现在想要展示所有的顺势作用原件,我应该怎样设置这个命令?

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

看不懂脚本,建议将结果粘贴到excel,手动筛选;

想学习linux可以:linux系统使用biolinux搭建生物信息分析环境linux命令处理生物大数据

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安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

展示所有的顺势作用原件可能会比较多。最好挑选一些感兴趣的。运行如下命令可以挑选所有的顺势作用原件。

cat PlantCARE_9210__plantCARE/plantCARE_output_PlantCARE_9210.tab | awk -F"\t"  'BEGIN{OFS="\t"} {print $1,$4,$4+length($3),$2}'>feature.bed


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