5 老师好,我的基因组gff文件基因的id名字后面还有外显子内含子等等 get_gene_exon_from_gff.pl

提取基因结构绘制structure的时候老是提取不成功。我的基因ID是对应的:

输入文件gff如下:

attachments-2019-04-2taVrkMf5cada5f8d60e5.jpg

ID文件如下:
attachments-2019-04-F6lV3Nf15cada60c23b50.jpg

脚本文件如下attachments-2019-04-wQlvdNsm5cada62ba726c.jpg
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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

看你的输入文件都没有问题,应该是脚本出来问题,可以把19行修改一下,如下:

attachments-2019-04-kKAYmljN5cada6bbc7b05.jpg

这个部分,已经更新到基因家族参考资料中,如果不修改脚本,可以重新下载打包文件。替换一下就可以;

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