转录组数据上传GEO

老师您好:数据上传遇到几个问题,想要请教您。

       1.文章投稿前,需要上传转录组数据到SRA或GEO,请问一般传哪个数据库?

       2. 转录组数据上传,是只上传测序数据,还是上传测序+组装,还是测序+组装+表达量等?

       3. 上传测序数据,是上传raw reads么?还是clean reads?

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1 个回答

Daitoue

一般是SRA,也有部分传了GEO,同时传GEO也会传原始数据,推荐看一看NCBI上传的视频,里面以植物为例介绍了转录组数据上传,当然GEO数据上传也介绍了:NCBI数据上传

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