rna-seq数据质量控制


老师好!下图是我使用Trimmomatic处理数据后的FASTQC质检报告,tile质量有warning,但是考虑到已经使用软件过滤掉了低质量的reads,这一项是否可以不做处理?另外overrepresented sequence也有warning,考虑到是rna-seq数据,是否可以忽略不计?

attachments-2019-04-3X2u67ad5cb6830f6e725.jpg

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

overrepresented sequence  这个可以不做处理;

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,3059 浏览
  • Tracy 提出于 2019-04-17 09:35