MCScanX中提取基因组注释文件时出错,我的物种的gff文件没有gene这一列 只有CDS和mRNA,请问下可以提取CDS或者mRNA序列吗?

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最佳答案 2019-04-18 10:20

你把mRNA当你的基因使吧,看着像甘蓝还是白菜来着。。。

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其它 1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的GFF文件只有mRNA需要处理一下,添加GENE行,可以参考这里处理一下:

https://www.omicsclass.com/article/816 

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