5 转录组数据分析(绘制KEGG通路)

水稻转录组数据绘制KEGG通路,显示attachments-2019-05-wvcx7EXO5cdcc062ce72f.jpg

按照如下格式输入:(查找物种时,网页始终无法显示,水稻选osa不知道对不对,或者gene ID有问题)

attachments-2019-05-zXcL3hLD5cdcc09af1ec4.jpg

请先 登录 后评论

1 个回答

Daitoue

kegg上关于水稻日本晴的有两个参考基因组,其中一个简写osa 对应的识别的是ncbi的geneID(纯数字) 另一个是dosa 可以识别你这个格式的基因编号,不过貌似这个dosa注释上的基因比较少,很多时候搜不出来结果,你可以简单的去kegg首页随便搜一个这个物种的基因看看是assign 还是no assign,所有即使输入了很多基因也可能没有结果,你自己去查找kegg上这两个对应的相关物种信息吧

attachments-2019-05-HLIXhgEI5cdcd180636a6.jpg
譬如:我用下面的这两个基因就是可用的,同时注意字母大小写格式问题。attachments-2019-05-gFDlBivy5cdcd30e96ae2.jpg

请先 登录 后评论