我做拟南芥的NBS基因家族分析时，最后经过hmm两次搜索一共获得192个基因，在SMRT中确认结构域的时候，最上面显示没有匹配的是10个，然后对下面出现结构域的基因一一检查，发现只有98个有该结构域，发表的文献中是165个左右，有两次文献中是这样。今天又提高E值，去除片段不完整度太低的基因，分3次提高E值，发现结果相差不大，都是在98个左右。还有其他几个物种中也是出现如此情况，200个，结果只有几个有匹配或没有匹配。做的过程是按照老师上课视频做的，应该是没问题的。请教哪里可能出现了问题？因为老师在做WARK家族的时候，我看在SMRT中只有两个没有匹配
