今天问了个测序公司销售,说是全转录组能够测到mRNA,LncRNA,circRNA,确实如此吗?
说对了一部分。
全转录组其实就是对一个样品建两个文库,一个LncRNA的, 一个小RNA,LncRNA文库分析的时候就把转录组(mRNA)的顺带也分析了,也能获得部分CircRNA的信息。总共就是得到mRNA、Lncrna、小RNA和部分circrna的分析。
但是如果想专门研究CircRNA的话,还是得做那种降解线性RNA的文库,文库很贵,不包含在全转录组里。