10 求助,如何获取基因与mRNA的对应关系?

老师好,最近在学习您的课程《基因家族分析》,在获取基因与mRNA的对应关系时遇到一个问题。由于根据结构域预测导出的结果中给的是mRNA的Name,而不是ID,因此无法参照您给的命令得到想要的结果,但又不知如何操作,望指点,谢谢~

第一行为gene,第二行为mRNA,文件为基因组的gff文件。

attachments-2019-05-ZZ44vb2R5ce654a081ddf.jpg

下图是cds序列

attachments-2019-05-rNpHxCQ35ce656314acbc.jpg下图是蛋白序列

attachments-2019-05-hZshi8ex5ce656b6344c2.jpg


请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

这个比较麻烦,需要编程才能完成,可以学习perl完成:

perl入门到精通perl语言高级

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,3073 浏览
  • TonY 提出于 2019-05-23 16:16

相似问题