由于原核生物的mRNA没有polyA,所以无法通过polyA的方式建库。
所以只能通过总RNA建库的方式,但是总RNA中核糖体RNA的比例很高,所以得先去除核糖体RNA,再进行建库。
另外,由于原核生物的基因组较小,基因比较密集,如果采用普通建库方式,则再定量时准确度会很低,所以需要采用链特异性文库进行测序。
总的来说,原核转录组建库需要先去除核糖体RNA,然后再采用链特异性转录组的方式建库。这样的优势是数据准确度高,但是价格会比较贵。
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