转录组结果中如何根据基因ID获得序列信息？

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如题

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1 个回答

omics007 2019-06-15 00:52

一般来说公司提供的分析结果里，都是以基因ID来指代基因的，如果想获得序列信息，要分有参还是无参的情况。

如果是有参物种，可以根据基因ID在基因组序列文件，或者CDS.fa文件里获取序列信息。

如果是无参物种，那么公司会使用软件把测序所得reads进行拼接从而获得一个unigene库，并对拼接好的基因进行命名，也就是ID，你可以根据ID在公司提供的unigene库里找到相应的序列信息。