二代测序和三代测序做转录组有什么区别?

导师让做点转录组看看样品的表达差异,听销售说有二代、三代技术,这两有什么区别呢?

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1 个回答

omics007

二代转录组目前来说就是illumina测序仪做的,价格便宜,读长短(一般是PE150),但是reads数量巨大,6G数据量就有2000万的reads了,适合用来做表达定量。

三代测序,目前两家主流的是PacBio和nanopore,价格远高于二代测序,优点是读长长,适合用来获取全长基因或者研究基因结构,但是reads数量一般,用来做定量的话,不是很合适。

既然你是想看样品的表达量,那做二代测序就行了。

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