基因家族蛋白序列相似性低,根据motif分析,有两个基因分组还有问题,请问遇到这种情况,应该用什么建树方法?
多序列比对之后删除gap区域吧,如果这种大量删除gap还不行,考虑用domian区域的序列构建进化树试试