老师您好,我想问一下在GEO中的双通道芯片里面可以下载到的series_matrix.txt文件中的数值是有正负求的,并且数值基本没有超过10的,是不是说明这些值已经是处理和对照的比值然后取了log2所得到的呢,如果是的话我是不是可以直接通过观察这个文件里面的值就可以看到我所研究的基因有没有发生上调和下调,然后可以直接用这个值来做我的基因家族成员表达的热图吗

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2 个回答

Daitoue

下载数据之后,想知道数据是如何处理的可以选择进入单样本的GSM accesion对应的单样本界面,了解对应的数据处理方法

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小不点

老师您好,对于文件中数值是这样解释的,没看懂这句话的意思,“Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1”

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