想具体了解双通道芯片，那你可以取GEO数据网站看看对应的数据介绍，网站会告诉你哪个是样本，另外，双通道芯片一般情况是一张芯片对应两个样本，课程进行介绍的只是原始数据标准化而已，标准化之后的结果一般是获取M值，也就是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据。
想具体了解双通道芯片，那你可以取GEO数据网站看看对应的数据介绍，网站会告诉你哪个是样本，另外，双通道芯片一般情况是一张芯片对应两个样本，课程进行介绍的只是原始数据标准化而已，标准化之后的结果一般是获取M值，也就是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据。
一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的，这个文件中我看值应该是去过log2的，我看网站介绍说文件里面的值是Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1，这句话是不是意思是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据，如果是的话我可以直接看出基因的差异表达了，我可以直接拿这个数据来作图说明我所研究的基因家族成员发生了差异表达吗？因为在文献中也没有见过这种情况的作图，希望老师指点一下，谢谢老师》
