输入的命令为:/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7。
首先ll检查下你的当前路径下的文件,然后检查一下ATH.cds ATH.bed rapa.cds rapa.bed 这四个文件,或者截图我们帮你看一下。
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老师,我都是用的原始的数据,在执行 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7 这条命令时,无法进行比对,没有生成 ATH.rapa.anchors 这个文件,导致后面的步骤无法进行;而且我是下载的最新版本的bioLINUX,麻烦老师帮忙看一下,谢谢老师。