isoseq3流程reads数量问题

老师您好,我在ncbi下载来pacbio的h5文件,转换成了subread.bam,里面reads大概是100W,接着用CCS处理得到ccs.bam里面reads大概是4W,之后用lima处理ccs.bam得到的结果大概用1000条reads,请问reads变得这么少了是哪里出现了问题呢?

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1 个回答

安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

你这是在过滤吗,过滤参数是什么啊?

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