5 我的转录本数据和gene ID不一致，所以我用的转录本ID来做的circle绘图，但是进行不下去
我用的是转录本ID 不知道这个软件是不是不能用转录本ID ，但是我转换成gene ID 也不行，请老师给建议
难道是由于染色体数量多于拟南芥所以这里也要改吗？
老师还请您指导
最佳答案 2019-07-31 20:54
文件里面的基因ID位置对应的染色体 要一致，你的命令没有截全，有文件路径写错了，你检查一下；
如果觉得我的回答对您有用，请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作！
我用的是转录本ID 不知道这个软件是不是不能用转录本ID ，但是我转换成gene ID 也不行，请老师给建议
难道是由于染色体数量多于拟南芥所以这里也要改吗？
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文件里面的基因ID位置对应的染色体 要一致，你的命令没有截全，有文件路径写错了，你检查一下；
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老师您好，geneID 我用的全部都是转录本ID 路径也反复检查了
看你的文件内容没有问题，感觉可能是文件格式有问题，你把editplus设置一下编码格式UTF-8重新生成一下chr.info这个文件。https://www.omicsclass.com/article/395
输入文件的行尾不要有多余的空白；
老师您好，我刚刚按照您的建议改了，还是出现后面更新的结果 改了chr.info 改了所有行尾多于的空白
我需要把config2.txt里面 chromosomes_revers=/LG[12345]/ 所有的染色体全部列出来吗？
老师，我把最后一次运行的结果补充上去了，谢谢您
谢谢老师，解决了，应该是两个问题1:染色体没写全 2：空格问题
不用谢，下次注意就好了；
好