老师,朋友们,请教个问题,tcga生存分析中,cox多因素分析后,筛选出的显著基因,用predict 功能构建显著性基因组成的风险模型。
1、是根据这个模型对样本算出的值进行高低风险评价,生存分析,以及ROC的吗?
2、predict 预测之后,可以查到样本对应的一个值,这个由若干个基因构成的公式 应该如何查看呢?3、文献中 说的是 coefficient * 基因值,然后相加,可是我试了一下,这个predict 得出的值并不是 这样的,那这个公式是什么样的?应该如何查看呢?
首先我们来看一下Cox 回归模型:
从公式来看, h(t, X) 与 (X1,X2...Xm) 这些影响因素是线性相关的。 1. 你采用的是Risk Score 是 后者
2. 我们课程中用的是前者。