老师请问一下,在用pheatmap做热图时,scale函数我有点不明白,这个函数可以对横行或者竖行标准化,即分别设置为row或者column,可是这样有个问题就是,如果我做横行标准化的话,就会出现横行某个基因的某个值明明比另一个基因的某个值大,但是颜色上确实值小的反而比值大的深,那这怎么办呢

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

按行标准化,颜色肯定代表了一行中的大小成正比,你再检查一下数据是不是有错误。

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  • 小不点 提出于 2019-08-16 20:36