我在GEO中找到3个不同的GSE系列，打算分析某个疾病中的实验组和对照组的对比情况，然后再对3个GSE系列求交集。问题如下：1.如果这3个GSE系列是在同一平台，都是单通道芯片，样本信息显示如下图，那么数据信息是不是现成的已经经过标准化的数据？2.2.如果这3个GSE系列不在同一GPL，可以在GEO2R后可以直接求交集吗？3.单个GSE***中都有实验组和对照组，但是有的GSE中是配对样本，有的是非配对样本，这些GSE系列可以放在一起比较吗？
1、绝大部分GEO芯片提供标准化数据，不同芯片类型对应的标准化形式不同
2、若三个实验数据来自同一芯片类型，理论上可以联合分析，注意需要去除批次效应
3、若三个实验来自不同芯片，对应的探针不同，数据无法相互对应。
