5 BSR-SEQ

您好老师~我在做BSR-seq数据分析的时候,总是出现Insert size out of range。我用的hasit2比对,samtools sort,然后再用java picard 来reoder,sort……。就出现了这个问题

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

没有遇到过这样的报错,这里有网上相关的问题:https://gatkforums.broadinstitute.org/gatk/discussion/7821/insert-size-out-of-range

可能是基因组染色体太大,应该用samtools index 建立bam索引才行;

这个没有测试过,你可以试一下; 

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