不同物种之间的共线性分析

在不同物种之间的共线性分析这一部分分析的最后一步,即运行命令

/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype --format=pdf --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout（出图时）出错，错误如图片所示

这是有可能哪里出错了？

在分析杨树和旱柳的共线性，分别有19条和38条染色体，前面的过程都和顺利，所需文件

以及SM.bed 都是对的，请问怎么解决?

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4 个回答

安生水 2019-09-16 09:56

擅长：perl,基因家族,linux,chip-seq

你再仔细检查一下你的输入文件是不是正确

omicsgene - 生物信息 2019-09-16 10:28

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

lotus 2019-09-16 14:32

谢谢，问题解决了

海阔天空 2019-09-23 13:13

不同物种共线性分析时，出现以下报错信息怎么解决呢？no such file or directory /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python