5 基因家族成员数

老师您好,按照课堂上的方法。我们找的到很多时候是一个基因家族各成员的多条转录本序列,我们在构建系统发育树时该如何选择?我看那篇nbs鉴定的原文在鉴定完之后还要根据功能注释手动删除,如果是按照功能注释选择,该怎么实现?

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最佳答案 2018-11-30 02:00

那篇nbs鉴定的原文 是哪篇?提供链接; 

手动鉴定结构域建议用NCBI的:https://www.omicsclass.com/article/310

如果一个基因的多条转录本都有结构域建议选择第一条转录本为基因的代表序列,如果只有一个转录本就用那个转录本就好;

例如下面:

attachments-2018-08-YjNJudh15b7cc6bd6143d.jpg



参考文献:https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-15-3


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Danio_rerio_lim2

Identification and distribution of the NBS-LRR gene family in the Cassava genomeattachments-2018-08-MZ0r3YjI5b7d0cb45abb9.jpg课程视频中没有图中标出的筛选基因家族成员的过程讲解

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  • Danio_rerio_lim2 提出于 2018-08-21 22:13

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