5 关于注释文件染色体位置信息
老师您好，在学习绘制基因在染色体位置构图那一节内容，自己操作在ncbi上下载的拟南芥注释文件并未发现其染色体信息（如图），如果按照课堂上的fadix命令，则构建不了染色体长度相关信息。如何根据在ncbi上的注释文件.gff进行fadix呢
最佳答案 2018-12-03 02:00
NCBI上的基因组数据库，会对基因组的染色体，基因编号等等重新命名编号，截图中已经有注释说明，请仔细看；
你要是不嫌麻烦可以根据GFF的注释信息提取ID的对应关系。
拟南芥建议上ensembl上下载基因组信息，会有更友好一些：https://www.omicsclass.com/article/58
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