宏病毒组得到的contig如何做系统发育分析,包括如何选取合适的序列?contig是否需要截取相应的基因片段?如何截取?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可以预测里面的基因,然后把基因截取出来,不同的样品按照基因的顺序链接成一个supergene,然后做多序列比对(clustalw),之后做进化树(MEGA)。

序列的批量截取合并,建议学习perl,或者python


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