老师,我们之前在NCBI已经上传过一株弧菌的二代测序基因组序列,现在想上传同一株菌的三代测序全基因组序列,想问下老师,Bioproject号是用之前二代序列的那个呢、还是重建一个呢?然后申请完bioproject和biosample后,对三代序列上传的位置有点迷茫,不知道三代序列应该上传至Genome/Genbank/SRA中的哪一个位置?希望老师可以指点指点,谢谢老师。

attachments-2019-10-8euDyMWo5dba3c49d3d41.png

请先 登录 后评论

最佳答案 2019-11-11 12:37

一个projet下面可以有很多biosample,是可以上传到一个bioproject下面的,一篇文章有可能既做了二代测序又做了三代测序;

三代数据也是上传到SRA数据库,对上传不了解可观看视频课程学习:NCBI数据上传二代fastq测序数据解读

请先 登录 后评论

其它 1 个回答

Bella

好的,谢谢老师,但是我看到视频教程里面只有上传至SRA和GEO库的教程,并没有上传到Genome的课程(三代序列WGS好像是要上传至Genome数据库)。

attachments-2019-10-DRAS1nRs5dba49241f69f.png

请先 登录 后评论
  • 2 关注
  • 0 收藏,5276 浏览
  • Bella 提出于 2019-10-31 09:45

相似问题