请问老师，gff 文件中有id 信息，但是cds 文件中只有转录本信息，如何进行修改课程脚本，进行cds 提取啊！ - 组学大讲堂问答社区

请问老师，gff 文件中有id 信息，但是cds 文件中只有转录本信息，如何进行修改课程脚本，进行cds 提取啊！

0 条评论
分类：perl

默认排序时间排序

1 个回答

omicsgene - 生物信息 2019-11-11 13:53

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

查看自己的GFF格式是否标准,主要看第二列，和最后一列；第二列得有gene，mRNA信息，最后一列的ID要与CDS里面的转录本ID一致。就能适用课程中的脚本：

https://www.omicsclass.com/article/816

1 关注
0 收藏，2404 浏览
。。。。。提出于 2019-11-11 13:22