看看samplesDown最早出现在代码哪里?是不是没有运行这行代码,生成这个变量;
R语言基础差,建议学习:R语言快速入门与提高、R语言画图、
resp = cases() %>% filter(~ project.project_id=='TCGA-COAD' &primary_site =='colon') %>% GenomicDataCommons::select(c(default_fields(cases()),'samples.sample_type')) %>% response_all()
resp %>% count()
[1] 454 ####我的网页数据是449,为什么这里是454?
case_name <- resp$results$submitter_id
download_name = substr(samplesDown,1,12)
####报错!Error in substr(samplesDown, 1, 12) : object 'samplesDown' not found
sample_download <- samplesDown[download_name %in% case_name]
######报错!Error: object 'samplesDown' not found
看看samplesDown最早出现在代码哪里?是不是没有运行这行代码,生成这个变量;
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https://www.omicsclass.com/article/672 老师的教程中没有samplesDown这行代码