mcscanX分析时用的是蛋白比对，在筛选基因家族串联重复基因对的时候未筛到，用了课程里的筛选方法，发现用的是CDS比对，我想问下哪个更准确？？？筛选结果不一样~
蛋白质和cds序列都可以；但是由于用mcscanX和blast方法去筛选可能导致结果不一致，结果任选其一就行；
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谢谢老师
那老师如果我用mcscanX分析基因组内共线性，画基因组的共线性图，用blast分析基因家族内的共线性，然后组合起来画图，文章里说明白就行吗？
