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老师,您好,我是在做有参转录组分析。在对基因组构建HISAT index时,所产生的splicesites.tsv,exons.tsv文件大小为0,但是并没有报错,请问这是什么原因呀,命令如下
HISAT
0 条评论
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转录组
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1 个回答
omicsgene
- 生物信息
2019-12-03 16:08
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
怀疑GTF格式有问题:
检查你的GTF与课程里面的GTF格式上有啥区别,对应修改一下;
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scau_bioinfo
提出于 2019-12-03 10:42
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hisat2 reads 与基因组进行比对出错
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