在进行基因组swissport注释时,注释到了一个细胞器基因(结果见下图1),把这个基因单独拿出来,进行nr注释,可以比对到近缘物种的叶绿体上(见下图2),但是将整条contig拿出来做nr注释,就得没有该叶绿体基因的注释信息(见下图3)。那么,该怎么合理的解释这种现象呢?
最好用基因的cds序列进行同源比对注释,直接scaffold序列注释不合理。
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