kaks计算过程问题

您好,我们采用了aln2axt.pl脚本运行,但运行得到的axt文件仍然不equal,我们检查了我们序列的长度,序列比对总长度是3的整倍数.序列都含有起始密码子ATG,请问一下如何解决呢?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

cds比对可以先蛋白比对,再转换成cds比对,就不会出现这种情况了:

批量比对计算参考这里:https://www.omicsclass.com/article/1939

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