如何手动将aln转成axt?

kaks计算用了很多种方法转换axt,最后计算都说不equal,查看序列都相同,也符合三的倍数,都含有ATG,但是就是不equal,查到老师说可以用notepad++手动转成axt,请问怎么转呢?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

cds比对可以先蛋白比对,再转换成cds比对,就不会出现这种情况了:

批量比对计算参考这里:https://www.omicsclass.com/article/1939

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