搜索10个motif，-minw 6 -maxw 100 生成meme.xml文件放进tbtools里，图上显示几乎每个基因都有motif7、1、8、2，但是检查meme.xml文件和meme.html文件里只有部分基因具有这些motif，遇到这种情况怎么办？有没有遇到过相同问题的同学老师，麻烦指点一下~感谢感谢！
tbtools生成图里几乎每个基因都有motif1（绿色）：
meme.xml文件里只有这一部分基因含有motif1：
题主解决了吗 我也遇到这样的问题
可能是MEME本身输出.txt文件的问题，不完整。去解析.xml文件貌似才是最完整的。
（doi: 10.1371/journal.pcbi.1008991）
您好，关于这个问题你可以看一下是不是有些距离相近的motif被合并在一块了，有时候tbtools绘图会有这种情况出现，另外在网页打开html文件的时候要勾选all sequence，和tbtools绘图的结果是一致的。
