请问老师我下载了根,茎,叶,花,种子的转录组数据,怎么做成基因家族热图形式。

就是这样的图,我看分析流程根据方法下载了转录组数据,有作图的教程,没有说怎么结合基因家族分析,数据怎么处理。attachments-2020-02-3wjGqKVW5e48ec7af3e65.png

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3 个回答

守得云开雾现。

请问老师是不是过程 和全基因组关联分析一样,和物种的全基因组数据bwa,samtools生成bam文件,再cuffdiff或者htseq-count进行分析,用edger分析得到gene的各种log2FoldChange pval PADJ等数据,再将筛选的处理的家族geneid挑出来进行热图绘制吗?






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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

如果只有原始数据fastq文件或者NCBI上下载的sra数据,就需要自己手动比对,定量分析。如果没有实验室没有服务器,自己得笔记本分析原始测序数据很吃力,不建议分析。

有兴趣可以看这门课程:二代测序转录组数据自主分析

我们公司也也可以分析转录组数据,可以联系我们,18510686772

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香蕉芝士卷

同学你好,能不能给一下视频购买链接啊?非常想要!!感谢感谢

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