学习有参转录组分析中遇见的问题

老师，您好，我在做转录组有参分析的过程中，跟着老师的步骤操作，但是第一个问题就难住了我，我在使用hisat2_extract_splice_sites.py的时候，系统提醒这个命令找不到，如图片所示，这是怎么回事呢？我用的是Linux系统虚拟机操作的。感谢回答！

默认排序时间排序

1 个回答

omicsgene - 生物信息 2020-03-04 11:16

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

二代测序转录组数据自主分析这个课程学习需要有一定的linux基础，基础薄弱可能跟不上老师的课，建议学习：linux系统使用

你这个问题需要自行安装 hisat2软件，并且把软件的安装目录添加到环境变量PATH中才行；