因为所做的物种没有基因组,我们做了三代转录组和二代转录组,但是在筛选基因的时候,二代转录组中的基因号和三代中的基因号是不同的,我要用什么手段把两个数据中的基因匹配呢?希望各位大神指教,感激不尽!!!
1. 可以将二代组装的转录本和三代数据组装的转录本进行blast 比对,计算一个相似百分比,划一个标准,比如98% 相似性。 找到相互对应的转录本。2. 一般三代数据用于构建转录本,二代数据用于定量。也可以将两者合并成一套转录本。