mRNA2geneID.txt文件不能正常获得

我的gff文件P.equestis.gene.gff 如下:

attachments-2020-03-myBk3ykH5e651b768cc3d.png

用命令perl script/mRNAid_to_geneid.pl P.equestis.gene.gff mRNA2geneID.txt生成mRNA2geneID文件时出错,文件如下:

attachments-2020-03-DSignuSF5e651ba7000ca.png

只有mRNA ID,没有gene ID,请问是怎么回事?是不是要对gff文件修改,怎么修改?


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的GFF文件缺失缺失Parent信息:

attachments-2020-03-pwiQ2BKV5e659f6352ca4.png

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