方法1,分别用hmmer搜索,再取交集.
方法2,把三个文件cat合并在一起,得到all.hmm文件,直接用hmm搜索;但是得到的结果你也是需要筛选的;
最后,没有说一下就得到同时具有三个结构域的方法,都需要前期搜索,后期筛选才能等到。
更多分析见:学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
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