这个问题可以写个perl脚本或者python脚本完成,分别用bioperl或者biopython包处理fasta文件会很方便，有相应课程；
perl求助，基因ID的对应替换perl脚本怎么写
如图，想要将gene Alisa对应的Bna基因ID对应替换上去，perl脚本该怎么写。。
#!/usr/bin/perl ;
#usage：perl repalce.pl list.file fa.file out.file
open LIST,$ARGV[0];
open FAFILE,$ARGV[1];
open OUT,">$ARGV[2]";
undef $/;#
$in=<FAFILE>;#
study $in;
$/="\n";#
while(<LIST>){
chomp;
my($new,$old)=split;
$in=~s/$old/$new/;
}
这个是网上的perl，out文件是空白的。。求老师看一下
