10 KaKs分析结果有三对,mscan分析结果有5对,且这5对中只有 2对和KaKs分析结果一致,为什么会这样?应该怎么取结果?

attachments-2020-03-qpmpbdyx5e7d879127108.jpg


attachments-2020-03-EVsyvD4q5e7d87cfc4fbf.jpg


gene_list

attachments-2020-03-gR40iNvj5e7d88065c865.jpg

mscan结果

attachments-2020-03-0GeUot7W5e7d88263878b.jpg


下面是KaKs分析结果

attachments-2020-03-aICQKnYv5e7d88cbd24ca.jpg

挑选出其中位于同一条染色体的

attachments-2020-03-mn1eHGwg5e7d8917cf15b.jpg换成基因名字作图:只有三对

attachments-2020-03-E78bGmUh5e7d89337d540.jpg

请先 登录 后评论

2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

这个分析方法不一样,挑选的条件不一样,结果不同也算正常,你选一个结果为准吧;

复制基因(包括串联重复,大片段复制,转座子转座等等)概念要弄明白,你要知道自己找的是什么基因,才好取舍。

更多可参考:https://www.omicsclass.com/article/1195

请先 登录 后评论
WKJ

attachments-2020-03-arbdMP2r5e7d954d31d01.jpg

请先 登录 后评论
  • 2 关注
  • 0 收藏,2344 浏览
  • WKJ 提出于 2020-03-27 13:06

相似问题