老师您好，我想分析样本的甲基化数据，但是TCGA里的脑肿瘤只有肿瘤样本，我能从GEO中下载健康样本的甲基化450的数据，可以吗？

可以将两者的数据直接按照甲基化探针直接merge嘛，批次效应怎么处理？

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你这两种数据无法放在一起分析差异甲基化。

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小朱大夫

谢谢老师的回答！

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  • 小朱大夫 提出于 2020-04-15 16:54

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