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WGCNA分析中,取材是,有5个植物发育时间点,两个品质高低不同的材料,三次生物学重复,也就是三十个样本,请问,针对其中某个材料某个时间点中的一次生物学重复不好的剔除后,影响WGCNA的分析吗?还有就是时间点可以作为一种表型作为输入文件吗?
剔除生物学重复
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WGCNA
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1 个回答
microRNA
2018-09-12 18:40
1. 生物学重复不太好的话,可以将该样本剔除。其实WGCNA的分析过程中也有异常样本的检测和剔除
2. 时间点可以做为表型。这样可以关联与时期相关的基因模块。
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邹先炎
提出于 2018-09-12 16:45
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