表达量太低的话取log 可能出现负值的；
医学癌症TCGA-生存分析课程相关问题-表达数据cpm计算log标准化后数据为什么变成了负值？
医学癌症TCGA-生存分析课程中基因表达数据处理时通过cmp对表达数据进行标准化处理
我分析的是mRNA的数据
运行下面代码，得到的数据如下图
norExpr <- DGEList(counts=datExpr)
norExpr <- calcNormFactors(norExpr)
运行下面的代码后，得到数据如下图
norExpr_cpm <- cpm(norExpr,prior.count=2, log=TRUE)
cpm标准化后，数据中有很多是负值，这是不是有问题呀？因为课程里提到cpm计算后数值比较大，所以选择进行log进行数据标准化。
而且后续进行单因素cox回归分析时，运行到
# 将单因素的结果汇总，形成一个dataframe
Univar <- ldply(Univar, data.frame)
得不到结果。
请各位老师和同学指点迷津，十分感谢！
