想获得一个基因家族的pfam索引号，首先你得有点线索才行：
1.InterPro数据库直接搜索
知道基因家族的功能描述，可通过pfam提供的关键字搜索得到相应的pfam号：https://www.ebi.ac.uk/interpro/search/text/
2. 文章搜索
比如，知道基因家族基因的缩写，如，NBS，MYB，AP2，WRKY等等, 就可以搜索一下相关的基因家族文章来从文章中获得：
如谷歌学术搜索，关键词：genome wide gene family + 基因家族缩写，筛选一下最新，套路文章很多，这里看一下第一个下载下来：
点击第一个结果，找到文章方法部分就可以找到PF号了，然后可以到pfam数据库搜索下载hmm文件：http://pfam.xfam.org/：
其他方法：
如果知道研究的基因家族为转录因子基因家族，可以到 plantTFDB数据库查询：https://www.omicsclass.com/article/358
或者知道基因家族的功能描述等，可到NCBI上查询：https://www.omicsclass.com/article/76
想学习基因家族分析可观看视频课程：《基因家族分析实操课程》
